MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp36

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011778	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868691
2	NC_011778	TGC	2	6	5317	5322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868691
3	NC_011778	CTCA	2	8	5344	5351	25 %	25 %	0 %	50 %	218868691
4	NC_011778	GTC	2	6	5377	5382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868691
5	NC_011778	T	6	6	5383	5388	0 %	100 %	0 %	0 %	218868691
6	NC_011778	TAC	2	6	5472	5477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868691
7	NC_011778	TTC	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868691
8	NC_011778	ATTA	2	8	5674	5681	50 %	50 %	0 %	0 %	218868691
9	NC_011778	T	6	6	5703	5708	0 %	100 %	0 %	0 %	218868691
10	NC_011778	TGA	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868691
11	NC_011778	GAG	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868691
12	NC_011778	T	7	7	5780	5786	0 %	100 %	0 %	0 %	218868691
13	NC_011778	T	6	6	5800	5805	0 %	100 %	0 %	0 %	218868691
14	NC_011778	ATC	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868691
15	NC_011778	T	6	6	5874	5879	0 %	100 %	0 %	0 %	218868691
16	NC_011778	TCA	2	6	5963	5968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868691
17	NC_011778	ATT	2	6	5999	6004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868691
18	NC_011778	AGT	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868691
19	NC_011778	AAT	2	6	6454	6459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868686
20	NC_011778	AT	3	6	6487	6492	50 %	50 %	0 %	0 %	218868686
21	NC_011778	A	6	6	6511	6516	100 %	0 %	0 %	0 %	218868686
22	NC_011778	T	8	8	6519	6526	0 %	100 %	0 %	0 %	218868686
23	NC_011778	T	6	6	6628	6633	0 %	100 %	0 %	0 %	218868686
24	NC_011778	TAAT	2	8	6643	6650	50 %	50 %	0 %	0 %	218868686
25	NC_011778	ATA	2	6	8171	8176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868684
26	NC_011778	T	8	8	8203	8210	0 %	100 %	0 %	0 %	218868684
27	NC_011778	GAA	2	6	8248	8253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868684
28	NC_011778	C	6	6	8405	8410	0 %	0 %	0 %	100 %	218868684
29	NC_011778	TAAT	2	8	8419	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	218868684
30	NC_011778	T	7	7	8454	8460	0 %	100 %	0 %	0 %	218868684
31	NC_011778	CTG	2	6	8461	8466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868684
32	NC_011778	T	6	6	8484	8489	0 %	100 %	0 %	0 %	218868684
33	NC_011778	AT	4	8	8506	8513	50 %	50 %	0 %	0 %	218868684
34	NC_011778	A	9	9	8604	8612	100 %	0 %	0 %	0 %	218868684
35	NC_011778	ATT	2	6	8636	8641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868684
36	NC_011778	TTA	2	6	8646	8651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868684
37	NC_011778	AGA	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868684
38	NC_011778	T	6	6	8772	8777	0 %	100 %	0 %	0 %	218868684
39	NC_011778	TGA	2	6	8798	8803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868684
40	NC_011778	ACAA	2	8	8805	8812	75 %	0 %	0 %	25 %	218868684
41	NC_011778	AT	3	6	8834	8839	50 %	50 %	0 %	0 %	218868684
42	NC_011778	ATAA	2	8	10293	10300	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
43	NC_011778	ATTT	2	8	10304	10311	25 %	75 %	0 %	0 %	218868679
44	NC_011778	TAA	2	6	10341	10346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
45	NC_011778	A	6	6	10400	10405	100 %	0 %	0 %	0 %	218868679
46	NC_011778	TGC	2	6	10430	10435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868679
47	NC_011778	CATATA	2	12	10453	10464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218868679
48	NC_011778	TTCTT	2	10	10470	10479	0 %	80 %	0 %	20 %	218868679
49	NC_011778	TAG	2	6	10502	10507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
50	NC_011778	ATAA	2	8	10588	10595	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
51	NC_011778	A	7	7	10600	10606	100 %	0 %	0 %	0 %	218868679
52	NC_011778	T	9	9	10618	10626	0 %	100 %	0 %	0 %	218868679
53	NC_011778	CTT	2	6	10634	10639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868679
54	NC_011778	TGA	2	6	10709	10714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
55	NC_011778	GAT	2	6	10720	10725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
56	NC_011778	TAAA	2	8	10787	10794	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
57	NC_011778	TAA	2	6	10815	10820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
58	NC_011778	GTT	2	6	10822	10827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868679
59	NC_011778	AGA	2	6	10914	10919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868679
60	NC_011778	GAAG	2	8	10963	10970	50 %	0 %	50 %	0 %	218868679
61	NC_011778	A	6	6	11020	11025	100 %	0 %	0 %	0 %	218868679
62	NC_011778	TGTTT	2	10	11042	11051	0 %	80 %	20 %	0 %	218868679
63	NC_011778	TGA	2	6	11052	11057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
64	NC_011778	TTAAT	2	10	11090	11099	40 %	60 %	0 %	0 %	218868679
65	NC_011778	T	6	6	11131	11136	0 %	100 %	0 %	0 %	218868679
66	NC_011778	GCAT	2	8	11152	11159	25 %	25 %	25 %	25 %	218868679
67	NC_011778	GTT	2	6	11193	11198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868679
68	NC_011778	CTG	2	6	11213	11218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868679
69	NC_011778	ATAA	2	8	11254	11261	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
70	NC_011778	ATG	2	6	11291	11296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
71	NC_011778	TAA	2	6	11315	11320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
72	NC_011778	A	6	6	11353	11358	100 %	0 %	0 %	0 %	218868679
73	NC_011778	GAT	2	6	11394	11399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
74	NC_011778	ATT	2	6	11428	11433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868679
75	NC_011778	TGAT	2	8	11447	11454	25 %	50 %	25 %	0 %	218868679
76	NC_011778	TAA	2	6	11516	11521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
77	NC_011778	A	6	6	11562	11567	100 %	0 %	0 %	0 %	218868679
78	NC_011778	CAT	2	6	11622	11627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868679
79	NC_011778	TTG	2	6	11630	11635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868679
80	NC_011778	ATG	2	6	11642	11647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
81	NC_011778	ATC	2	6	11674	11679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868679
82	NC_011778	G	6	6	11688	11693	0 %	0 %	100 %	0 %	218868679
83	NC_011778	A	6	6	11714	11719	100 %	0 %	0 %	0 %	218868679
84	NC_011778	TAA	2	6	11723	11728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
85	NC_011778	AT	3	6	11787	11792	50 %	50 %	0 %	0 %	218868679
86	NC_011778	TGA	2	6	11835	11840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
87	NC_011778	GGT	2	6	11874	11879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218868679
88	NC_011778	ATT	2	6	11939	11944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868679
89	NC_011778	A	6	6	12604	12609	100 %	0 %	0 %	0 %	218868669
90	NC_011778	TAT	2	6	12612	12617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868669
91	NC_011778	GTTTAT	2	12	12626	12637	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218868669
92	NC_011778	T	6	6	12656	12661	0 %	100 %	0 %	0 %	218868669
93	NC_011778	ACACT	2	10	12764	12773	40 %	20 %	0 %	40 %	218868669
94	NC_011778	AAAAGA	2	12	12780	12791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218868669
95	NC_011778	TAA	2	6	12819	12824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868669
96	NC_011778	AGA	2	6	12853	12858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868669
97	NC_011778	A	6	6	12868	12873	100 %	0 %	0 %	0 %	218868669
98	NC_011778	CTT	2	6	12880	12885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868669
99	NC_011778	AAT	3	9	12922	12930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868669
100	NC_011778	A	6	6	12931	12936	100 %	0 %	0 %	0 %	218868669
101	NC_011778	A	7	7	12948	12954	100 %	0 %	0 %	0 %	218868669
102	NC_011778	TTA	2	6	12970	12975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868669
103	NC_011778	ATA	2	6	12986	12991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868669
104	NC_011778	AT	4	8	12994	13001	50 %	50 %	0 %	0 %	218868669
105	NC_011778	A	6	6	13021	13026	100 %	0 %	0 %	0 %	218868669
106	NC_011778	A	6	6	13045	13050	100 %	0 %	0 %	0 %	218868669
107	NC_011778	GCG	2	6	13076	13081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218868669
108	NC_011778	GAT	2	6	13099	13104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868669
109	NC_011778	CAAGAG	2	12	13141	13152	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218868669
110	NC_011778	TAGA	2	8	13157	13164	50 %	25 %	25 %	0 %	218868669
111	NC_011778	GAA	2	6	13180	13185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868669
112	NC_011778	GAA	2	6	13189	13194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868669
113	NC_011778	AGA	3	9	13197	13205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868669
114	NC_011778	GAAAA	2	10	13214	13223	80 %	0 %	20 %	0 %	218868669
115	NC_011778	T	6	6	13586	13591	0 %	100 %	0 %	0 %	218868683
116	NC_011778	TAA	2	6	13613	13618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868683
117	NC_011778	TTTC	2	8	13620	13627	0 %	75 %	0 %	25 %	218868683
118	NC_011778	AAG	2	6	13629	13634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868683
119	NC_011778	TA	3	6	13693	13698	50 %	50 %	0 %	0 %	218868683
120	NC_011778	CTT	2	6	13722	13727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868683
121	NC_011778	TAA	2	6	13755	13760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868683
122	NC_011778	ATT	2	6	13813	13818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868683
123	NC_011778	CTA	2	6	13925	13930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868683
124	NC_011778	TAT	2	6	13942	13947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868683
125	NC_011778	AATCAA	2	12	13953	13964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218868683
126	NC_011778	AAT	2	6	13999	14004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868683
127	NC_011778	ATC	2	6	14020	14025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868683
128	NC_011778	AAAT	2	8	14067	14074	75 %	25 %	0 %	0 %	218868683
129	NC_011778	ATTTT	2	10	14081	14090	20 %	80 %	0 %	0 %	218868683
130	NC_011778	TTA	2	6	14162	14167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868683
131	NC_011778	AAG	2	6	14172	14177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868683
132	NC_011778	ATCA	2	8	14200	14207	50 %	25 %	0 %	25 %	218868683
133	NC_011778	T	6	6	14215	14220	0 %	100 %	0 %	0 %	218868683
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397	NC_011778	TTCT	2	8	36175	36182	0 %	75 %	0 %	25 %	218868690
398	NC_011778	GTT	2	6	36219	36224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868690
399	NC_011778	TAT	2	6	36225	36230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868690
400	NC_011778	A	6	6	36234	36239	100 %	0 %	0 %	0 %	218868690
401	NC_011778	AAT	2	6	36250	36255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868690
402	NC_011778	GAG	2	6	36295	36300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868690
403	NC_011778	CAA	2	6	36382	36387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868690

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.